辞任劇の後、松本氏は2012年12月の第46回衆議院議員総選挙に出馬したものの、民主党への大逆風も重なり落選。そのまま国政の表舞台から姿を消すこととなりました。
その後は地元・福岡で社会活動や後進の支援に専念していましたが、2018年7月21日、福岡市内の病院で肺がんのため67歳で逝去しました。
訃報が伝えられた際にも、環境相時代に推進した生物多様性条約第10回締約国会議（COP10）の成功など政策面での功績を振り返る声があった一方、やはり2011年の恫喝劇を思い起こす人が少なくありませんでした。
